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« Samael Aun Weor » est né Víctor Manuel Gómez Rodríguez à Bogota, en Colombie. On sait peu de choses de son enfance et de sa famille si ce n’est qu’il avait un frère et que son père s’est remarié après un divorce.
Samael a commencé à enseigner dès 1948 et, en 1950, désormais sous le nom d’Aun Weor, il parvient à faire publier avec quelques disciples proches « The Perfect Matrimony of Kinder » (ou La Porte pour Entrer dans l’Initiation). Le livre, qui par la suite sera titré « The Perfect Matrimony » (Le Mariage parfait) révélait le secret de la sexualité comme la pierre angulaire des grandes religions du monde. Cette façon de parler de sexe sans détours a suscité le dédain de la majorité du public à l’époque. Perçu comme une personne immorale proférant un discours à caractère pornographique, Aun Weor s’est vu contraint de fuir des foules hostiles qui souhaitaient le faire taire par tous les moyens. Il a été emprisonné de nombreuses fois et au moins une fois pour avoir « guéri un malade sans permission ». Tandis qu’il était en prison, quoi qu’il en soit, il a continué à écrire des livres. Vers cette époque, Aun Weor et son petit mais néanmoins croissant groupe de disciples construisent le Sanctuarium Sumum Supremum : un « temple souterrain » dans les montagnes de la Sierra Nevada.
Au milieu des années 50, Aun Weor était devenu Samael Aun Weor, affirmant le choix du « chemin droit » (« Straight Path »), il (Aun Weor) avait commencé à incarner son Glorian ou Logos particulier (Samael). Plus tard, dans le Message Aquarien, il a affirmé que le Maitreya Buddha Samael est l’Avatar Kalki du Nouvel Age. » L’Avatar Kalkien et Maitreya Buddha sont selon lui le même « Chevalier Blanc » (« White Rider ») du Livre de la Révélation (Weor 2004b). Comme Samael est historiquement synonyme à la fois d’une connotation démoniaque, tel que le « Dieu aveugle », et d’un Ange, il a dit avoir été, dans des incarnations précédentes, un « Bodhisattva déchu » ou ange déchu qui s’est depuis repenti. De plus, il a affirmé être l’enseignant supérieur prophétisé par Rudolf Steiner et H.P. Blavatsky.
Avant 1960, il avait publié vingt autres livres sur des sujets allant de l’endocrinologie et de la criminologie au yoga Kundalini. Des centres gnostiques furent établis au Mexique, Panama, au Salvador et au Costa Rica et l’on vit la fondation de l’Association Gnostique pour les études scientifiques, anthropologiques et culturelles (AGEAC). Une relation triangulaire se forma entre le Mouvement gnostique mondial (World Gnostic Movement) fondé par Samael Aun Weor, l’Action de libération sud-américaine (AGLA) conduite par Francisco Propato en Argentine et le Sivananda Aryabarta Ashram dirigé par Swami Sivananda en Inde (Weor 2004b). Cependant, le Mouvement gnostique a connu des crises et retours en arrière dramatiques. A l’époque de la publication de l’édition révisée du Parfait Mariage (1961), le mouvement était en voie d’extinction. Aun Weor écrivit que « ceux qui restèrent dans le Mouvement pouvaient se compter sur les doigts d’une main » (Weor 2001a). Néanmoins, avant sa mort, Samael Aun Weor avait totalement rétabli la large dimension internationale que le mouvement avait atteint par le passé.
Dans les années 60, il a continué d’écrire de nombreux livres sur des sujets ésotériques comme l’astrologie hermétique, les Saucières volantes, la Cabbale, etc.
Dans ce qui devait être la dernière décennie de sa vie, il écrivit des œuvres comme Parsifal Dévoilé, qui détaille le symbolisme ésotérique de l’opéra de Wagner, et Anthropologie Gnostique dans laquelle il critique avec virulence les théories de Darwin, Haeckel, « et leurs partisans ». Les livres La Grande Rébellion, Traité de psychologie révolutionnaire et La Révolution de la dialectique constituent des ouvrages de référence pour la connaissance large de la psychologie ésotérique que l’on trouve ancrée dans toutes les religions.
Bien qu`il n`ait jamais reçu de salaire pour ses livres, Samael Aun Weor renonça publiquement à tous ses droits d`auteur lors du Congrès gnostique de 1976 dans le but de favoriser une diffusion plus large de ses écrits. Durant cette période, il préparait le plus haut véhicule de sa doctrine, la « Pistis Sophia Dévoilée » dans lequel il médite vers par vers sur le texte éminemment ésotérique de la Pistis Sophia. En août 1977, il est déjà atteint d`un cancer de l`estomac mais continue à inspirer non seulement ses étudiants mais aussi le public en général à travers des discours d`une supériorité remarquable, donnant des interviews radiophoniques et télévisées lors de tournées au Mexique. Les douleurs dues à sa maladie l`ont finalement forcé à s`arrêter et son état s`est progressivement aggravé jusqu`à sa mort survenue le 24 décembre 1977. Sa femme et ses enfants lui ont survécu.

